弥陀寺始建于唐代，是蓬莱阁景区内唯一的佛教寺庙。该寺原胜极一时，因禁佛运动，虽没有遭到拆除之灾，也一度僧尼还俗，门庭冷落。 
　　明万历十一年（1583年），佛教名僧憨山德清（明末四大禅僧之一）来鲁传教，在山东地区的佛教界影响很深，他的弟子遍布各地。这时，蓬莱阁内的弥陀寺香火复盛，渐渐扩建成今天的规模。

　　弥陀，是号称西方三圣之一阿弥陀佛的简称（西方三圣指的是阿弥陀佛，观世音、大势至）。弥陀寺，是供奉阿弥陀佛的寺庙。